Công ty Cổ phần nước sạch Lai Châu tiền thân là Công ty Xây dựng và Cấp nước Lai Châu, được thành lập theo Quyết định số 138/QĐ-UBND ngày 31/01/2004 của UBND tỉnh Lai Châu.
Ngày 30/12/2005, UBND tỉnh Lai Châu ra Quyết định số 1789/QĐ-UBND về việc chuyển Công ty Xây dựng và Cấp nước Lai Châu thành Công ty TNHH Xây dựng và Cấp nước Lai Châu.
Ngày 31/03/2015 UBND tỉnh Lai Châu có Quyết định số 261/QĐ-UBND phê duyệt phương án cổ phần hóa và chuyển Công ty TNHH Xây dựng và Cấp nước Lai Châu thành Công ty cổ phần.
Ngày 14/12/2015 Công ty cổ phần Nước sạch Lai Châu tổ chức Đại hội cổ đông lần thứ nhất và ngày 05/01/2016 Công ty chính thức chuyển sang hoạt động theo mô hình công ty cổ phần.
Trong giai đoạn đầu khi mới được thành lập, số nhân viên của Công ty chỉ mới có 7 người với công suất cấp nước chỉ có 300 m3/ngày đêm. Hiện nay, tổng công suất thiết kế hệ thống cấp nước của Công ty là là 25.500 m3/ngày đêm.